Elyse Allan fut nommée au poste de présidente et chef de la direction de GE Canada en octobre 2004, avec pour mission d’étendre les activités de GE au Canada, et de faire progresser le leadership de la société sur le plan de la technologie, des médias, et des services financiers. Cette nomination a marqué le retour d’Elyse au sein de GE, où elle avait commencé sa carrière en 1984. Elle a travaillé dans le domaine du marketing intégré aux États-Unis auprès d’un certain nombre d’entreprises industrielles, et occupé des postes importants à GE Canada dans le domaine social, de l’éclairage et des électroménagers.

En dehors de son travail au sein de GE, elle contribue en tant que directrice du Conseil canadien des chefs d’entreprise, de l’Institut C.D. Howe, et du Forum des politiques publiques. Elle a participé à la Table ronde nationale sur l'environnement et l'économie. Elle exerce les fonctions de directrice du Musée royal de l’Ontario et du Mississauga International Investment Board. Elle a autrefois présidé Providence Healthcare, un important établissement de soins de santé situé à Toronto.

Avant d’occuper son poste actuel, Elyse a été présidente-directrice générale du Toronto Board of Trade et, avant cela, cadre supérieur à Ontario Hydro.